Al CES di Las Vegas Asus ha sbandierato la Sabertooth 990FX/GEN3.0 R2.0 come la prima scheda madre basata su chipset AMD in grado di supportare l'interconnessione PCIe 3.0 delle moderne schede grafiche realizzate da AMD e Nvidia.
Tutti i chipset della casa di Sunnyvale e le CPU con controller PCIe integrato non supportano nativamente questo tipo di connessione, che invece è uno standard per le ultime CPU Intel, e per farlo il colosso taiwanese ha utilizzato un costoso switch PEX 8747 (soluzione già nota perchè presente sulle mainboard con chipset Intel Z77 per ampliare il numero di linee PCIe 3.0 a disposizione delle configurazioni 3 e 4-way).
Il PEX 8747 è un chip in grado di offrire 48 linee I/O PCIe 3.0, sulla Sabertooth 990FX/GEN3.0 R2.0 è montato a valle su una delle due connessioni PCIe 16x 2.0, gestite dal northbridge 990FX, in modo da convertire il segnale in PCIe 3.0. Da qui può pilotare una sola scheda video (16x) sullo slot 1 (PCIe 3.0), due schede (16x + 16x) sugli slot 1 e 3, oppure tre (16x + 8x + 8x) su quelli 1,3 e 4. Siccome il chipset 990FX non offre il "disengaging", il PEX 8747 si trova a disposizione una banda effettiva di soli 8GB al secondo da/verso il chipset ed una da 32GB/s con gli slot. Questa situazione crea un pesante overhead e latenza che vanifica la presenza del controller PCIe 3.0.